Рекомендованное средство для чистки термоса от остатков кофе, чая или других напитков - смесь белого уксуса и воды (1-на часть уксуса на 3 части воды). Концентрация может быть более высокой, если необходимо.
Влейте смесь в термос и оставьте на время. Если у вас есть бутылочные щетки протрите ими насколько это возможно. После чего ополосните в проточной воде.
При необходимости повторите операцию.